此外，近日有人权组织称利比亚冲突双方都犯下了战争罪。而有些媒体甚至称，利比亚“全国过渡委员会”武装虐待和枪杀外国雇佣兵。总部设在伦敦的一个国际人权组织13日发布报告说，虽然效忠前领导人卡扎菲的部队犯下广泛的战争罪行，但临时政府的战斗人员也有侵犯人权的行为，在一些情况下违反了国际法。而据俄罗斯一家报纸14日报道，一名克罗地亚记者13日从米苏拉塔发回消息称，当地“全国过渡委员会”武装在市中心公开打死卡扎菲雇佣兵。这些雇佣兵来自各个不同国家，共85人，法庭按照战时法律审讯了仅仅几分钟就做出判决。犯人被允许说最后一句话，并告知他们来自哪个国家，其中有11名雇佣兵表示他们来自乌克兰。乌克兰媒体转引上述报纸称，利比亚“全国过渡委员会”武装在米苏拉塔公开枪决数十名外籍雇佣兵，这些人来自俄罗斯、乌克兰和塞尔维亚。据在米苏拉塔的“全国过渡委员会”武装指挥官称，这些雇佣兵是为钱杀人的凶手。

　　此外，一个位于马里和尼日尔的人权组织14日也指责利比亚新政权关押和虐待300名外国人，这些外国人大多数是来自马里和尼日尔的柏柏尔人，他们被怀疑是支持卡扎菲的外国雇佣军。这个名叫“保护在利比亚外国人”的人权组织当天称，目前在利比亚的外国人正遭遇不公正的对待，特别是来自马里和尼日尔的柏柏尔人，更是受到利比亚新政权的拘捕和虐待。该组织称，根据其在利比亚收集的证据显示，到目前为止，至少发生6起来自马里和尼日尔的柏柏尔人失踪案件。此外，还有传言称这些失踪的柏柏尔人已经被集体杀死并埋葬在一起。该组织称已经要求马里和尼日尔政府对利比亚新政权施加压力，要求释放遭利比亚新政权拘捕的柏柏尔人。据了解，在卡扎菲执政期间，马里和尼日尔两国均受到了卡扎菲政权的诸多关照。今年2月份利比亚爆发反卡扎菲运动后，一些马里人和尼日尔人在马里北部城镇基达尔和尼日尔北部城镇阿加德兹成立了一个名叫“保护利比亚外国人”的非政府组织，以便对在利比亚的马里人和尼日尔人实施必要的援助。