中药材产业是磐安的传统优势产业。近几年，全县中药材年种植面积达8万亩以上(含木本药材)，占全省总面积(34万亩)的23%，是全省最大的中药材主产区，白术、元胡、浙贝母、玄参、天麻的产量均占全国的20%以上。全县中药材产量1万余吨，产值达2亿元以上，占全县农业总产值的30%左右。中药材产业一直是我县农业的重要支柱产业，在我县农村经济中占有举足轻重的地位，是农民收入的主要来源。

　　近年来，我县立足生态环境优势和药材资源优势，积极推进中药材规范化、标准化、产业化发展。在省财政厅、省经贸委、省农业厅的大力支持下，建立了多个中药材示范基地。并组织实施了浙江省无公害白术、元胡标准化示范推广项目，建立了无公害白术、元胡标准化示范基地2万亩，并通过省农业厅等单位组成的专家组验收；建立了玄参、浙贝母标准化示范基地1.5万亩，其中浙贝母标准化示范基地被列为浙江省重点农业标准化实施示范项目和国家农业标准化示范区二类项目，1万亩浙贝母标准化示范基地已通过省质监局、省农业厅的验收。中药材良种基地建设进一步加强，近年来，全县建立了浙贝1号、浙胡1号、浙芍1号种苗基地3000多亩，提高了中药材良种覆盖率。此外，还先后建立了浙贝母优质高产高效示范基地1000亩，无公害元胡基地3000亩，玄参GAP技术示范推广基地3000亩，无公害白术出口示范基地3000亩等等。基地建设取得较好的经济效益和社会效益，对全县乃至全省中药材的标准化、规范化生产起良好的示范带动作用。

　　随着中药材GAP的实施，我县洁净无污染的生态环境和丰富的道地药材引起许多企业的广泛关注，成为企业投资建立GAP基地的热土。金陵药业在大盘、安文、尚湖、九和等地建立了3000亩玄参GAP基地，兰溪三江中药饮片有限公司在新渥建立了1000亩浙贝母GAP基地，上海华宇医药集团与科信药业有限公司合作创办了华信中药材有限公司，对中药材GAP基地的药材进行就地加工，形成中药材种植、加工一体化的规范化生产体系，生产优质中药材及其饮片。中国药材集团公司、扬子江药业、郑州长甲集团等有意来磐安建立GAP基地。此外，我县企业、经营户也积极参与中药材GAP基地建设。在中药材GAP基地建设中，初步形成了“企业为主，部门服务”的运作机制。全县中药材GAP基地面积12000亩，有3038亩天麻获IMO有机证书，并有1000亩浙贝母、2000亩白术和500亩元胡获绿色药用植物及制剂产品证书。在龙头企业的带动下，加上县政府对中药材产业化的扶持，药农的观念有所转变，药材生产逐渐由零星分散生产转向连片规模经营，涌现出了一批中药材种植大户。如大盘镇周志兴种植白术80亩，仁川镇羊昌财种植白术150亩、刘生根种植玄参135亩、羊东山种植玉竹120亩，新渥镇陈凤阳和深泽乡陈柏松在当地分别种植了40亩和30亩白芍等等。中药材生产逐渐走向基地化、业主化、规模化，出现了“满山开药花，遍地闻药香”的喜人景象。

　　基地建设推动了全县中药材生产的发展，提升了道地药材的产量和质量。近几年，我县浙贝母种植面积达8000多亩，产量800余吨，占全国产量的一半以上。全国80%以上的浙贝母商品通过我县销售，成为全国名副其实的浙贝母集散中心。我县玉竹常年种植面积3000多亩，年产量200吨，是全国重要玉竹出口生产基地。我县天麻常年种植面积300多万穴，产量200吨，居全国之首，被誉为“天麻之都”。此外，桔梗、太子参、丹参、丹皮、吴茱萸、三棱、黄栀子等药材面积都很大。

　　我县与省中药研究所等单位建立了长期稳定的合作关系，承担了多项国家、省级重点攻关项目。完成了国家“七五”重点攻关项目《白术、元胡优质高产模式栽培技术研究》、“九五”攻关项目《白术规范化种植研究》和“十五”攻关项目《雷公藤规范化种植研究》，并通过国家级验收。近年来，实施了《富含功效成分的白术新品种选育》、《“浙八味”种质资源保护和开发利用》、《玄参等三种“磐五味”质量控制关键技术的研究及示范推广》项目，广泛收集了“浙八味”种质资源，建立了“浙八味”种质资源圃，开展白术良种选育(包括遗传性状鉴定、诱变试验、组培试验等)、元胡良种选育、浙贝母航天育种、“磐五味”DNA测定等科研。《富含功效成分的白术新品种选育》项目通过验收，并培育了浙贝1号、浙胡1号、浙芍1号等道地药材良种，通过品种认定，成功引进了黄栀子、西红花、雷公藤、日本当归、金银花等药材新品种，推广了白术、元胡、浙贝母优质高产栽培技术，天麻有性繁殖技术等，为我县中药材生产提供了有力的技术支撑。

　　中药材的深加工已经起步，发展势头良好。全县获《药品生产许可证》的饮片企业3家，即大宇医药公司饮片厂、华信中药材有限公司、大晟中药饮片有限公司。华信中药材有限公司于2005年11月通过GMP认证，是全省首家通过GMP认证的饮片生产企业。目前，我县饮片企业生产的饮片品种400多个，年销售饮片1000多吨，销售额4000多万元。其中白术、浙贝母、天麻、玄参、元胡等本县大宗药材的饮片占总量的一半以上。大晟中药饮片有限公司的产品除中药饮片外，还有灵芝孢子粉胶囊等保健产品，其生产的中药饮片以出口为主。除饮片生产企业外，我县药材市场经营户年加工销售的切片1000吨以上。一些有资金实力的中药材经营大户有意创办中药饮片企业，全县中药材深加工出现良好的发展势头。依托我县丰富的中药材资源优势，保健品系列开发进一步加强。健源皇野生植物制品有限公司开发了健保冲剂和健保胶囊，并已获卫生部健字号批准文号。